У Сектору за регионални развој и унапређење предузетништва се образују уже унутрашње јединице:

У Одељењу за политику развоја МСПП обављају се послови који се односе на: праћење и анализирање пословања и пословног окружења малих и средњих предузећа и предузетништва;предлагање мера економске политике за развој малих и средњих предузећа и предузетништва и праћење ефеката предложених мера; припрему и координацију реализације политике развоја малих и средњих предузећа и предузетништва у Републици Србији; иницирање, координацију и учествовање у реализацији донаторских активности у области подстицања развоја малих и средњих предузећа и предузетништва; пеализацију конкретних програма и инструмената за подршку политике развоја МСПП, активности у вези са применом Акта о МСПП; предлагање мера и елемената за законска и друга решења у циљу унапређења пословног окружења малих и средњих предузећа и предузетништва, као и други послови из ове области.

У Одељењу за политику регионалног развоја и ИПА пројекте се обављају послови иницирања и предлагања мера ради стварања предуслова за смањење разлика у економском и укупном друштвеном стандарду. У овом одељењу се анализирају расположиви природни, привредни, људски и други ресурси, дефинишу се методологије за мерење степена развијености, израђују мапе територијалних делова Републике Србије дефинисане по различитим критеријумима са циљем дефинисања развијености локалних заједница. Одавде потичу и иницијативе за израду закона и других прописа као и иницијативе за израду развојних стратегија.

Поред тога у овом одељењу се обављају послови институционалних прилагођавања за потребе коришећња IPA фонда. Стога, постоји посебан одсек за ИПА пројекте. У њему се организују активности на програмирању и спровођењу пројеката који се финансирају из фондова ЕУ.